Šiandien stovinčius rūmus pastatydino grafas Aleksandras Pliateris. Jo žmonos iniciatyva buvo pradėtas sodinti parkas. Dvaro ansamblis kurtas 1880–1897 m. Vilkėno dvaro rūmai yra neorenesansinis dviejų aukštų nesudėtingo simetriško plano statinys su bokštu. Pagrindiniame fasade keturių mūrinių kolonų portikas, galiniame fasade – balkonas. Vilkėno dvaro rūmų architektas, norėdamas suteikti rūmams lengvumo ir grakštumo, virš rizalitų suprojektavo savotišką karpyto silueto frontonėlį su Pliaterių giminės herbu viduje. Vaizdingame ir kalvotame reljefe įrengtas parkas priklauso mišriosios kompozicijos parkų grupei.
1993 m. rūmai ir parkas grąžinti Pliaterių paveldėtojai Laimei Felicijai Pliaterienei.
2007 metais restauruota Vilkėno dvaro rūmų išorė.